Speciální modul určený pro správce systému Prytanis na straně uživatele. Jako takový zahrnuje následující základní funkce:
- zavádění uživatelů systému Prytanis,
- správa přístupových údajů,
- strukturování aplikací a konfigurace jednotlivých modulů,
- definice a přidělování uživatelských funkcí.
Administrátor rovněž může vytvářet skupiny uživatelů s různými přístupovými právy pro aplikace IS Prytanis. Zaměstnanci tak mají přístup pouze k těm aplikacím a modulům, které vyžadují ke své práci.